R语言及Bioconductor在基因组分析中的应用
发布日期:2006-11-14 浏览次
『内容简介』
本书是国内第一本系统介绍R语言及Bioconductor软件包的图书。R语言是一种计算机程序设计语言，也是一个开放式的软件开发平台。R语言具有强大的数学统计分析和科学数据可视化功能，能提供各种数据处理、统计分析及图形显示工具。软件研究人员可以在R语言这个开放平台上不断扩充其功能，开发出面向特定应用的软件。Bioconductor就是一个基于R语言的、面向基因组信息分析的应用软件集合。Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前，它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具，其中大多数工具是针对DNA微阵列或基因芯片数据的处理、分析、注释及可视化的。同时，Bioconductor还提供许多与DNA微阵列相关的数据包。
本书面向计算机应用人员，可供从事数学统计分析和生物信息学研究及应用的有关人员参考。
『目录』
上篇R语言
第1章R语言简介
第2章R语言的基本数据结构
第3章R语言对象
第4章分组因子
第5章数组和矩阵
第6章数据列表和数据单
第7章导入导出数据
第8章组合表达式和控制语句
第9章函数
第10章包
第11章R语言中的统计
第12章图形函数
下篇Bioconductor及其应用
第13章Bioconductor与DNA微阵列数据处理
第14章Bioconductor的使用
第15章数据库访问
第16章图形及用户接口
第17章图结构
第18章通用工具
第19章注释
第20章基因本体学
第21章微阵列数据预处理
第22章数据分析
第23章微阵列比较基因组杂交
第24章蛋白质组学
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